D'un point de vue vitesse, sachez que MultideskOS est plus rapide que les autres, pour une simple raison : la lecture sur les disquettes et disques durs est plus lente que le temps que met le processeur pour analyser et décoder. Autrement dit, il est plus rapide de charger un programme de 5 Ko en mode texte que de lancer un programme compilé de 150 Ko, parce que la tête du disque dur ne doit bouger qu'une seule fois, le programme tenant dans un seul secteur du disque. De plus, MultideskOS utilise des techniques intelligentes et complexes qui permettent à n'importe quel programme de se charger entre une demi seconde et deux secondes suivant le type de machine. Le programme est géré comme interprété et compilé.